انتخاب نوع هیتر به ابعاد گلخانه، نوع سوخت در دسترس و میزان یکنواختی دمای مورد نیاز بستگی دارد.
برای گرمایش گلخانه دو گزینه رایج وجود دارد: هیتر گازی با فن دمنده و هیتر جت. هر کدام مزیت خود را دارند.
هیتر گازی گلخانه‌ای
برای گرمایش پیوسته و یکنواخت مناسب است و معمولاً با ترموستات محیطی کنترل می‌شود. در گلخانه‌هایی که ثبات دما اهمیت دارد گزینه بهتری است.
هیتر جت
گرمای سریع و موضعی ایجاد می‌کند و برای فضاهایی که گرمایش مقطعی لازم دارند مناسب‌تر است.
در گلخانه‌های بزرگ استفاده از چند واحد کوچک‌تر معمولاً یکنواختی بهتری نسبت به یک واحد بزرگ ایجاد می‌کند.